qPCR versus LAMP
qPCR versus LAMP
La qPCR (PCR en temps réel) et la LAMP (amplification isotherme médiée par boucle) sont deux méthodes utilisées pour amplifier et détecter des séquences d’ADN spécifiques.
La qPCR est une méthode qui amplifie l’ADN à l’aide de la PCR (amplification en chaîne par polymérase) et mesure simultanément la quantité d’ADN amplifié à l’aide de colorants fluorescents. Le signal fluorescent augmente à mesure que la PCR amplifie l’ADN, et la quantité d’ADN amplifié peut être quantifiée en comparant le signal fluorescent à une courbe standard. La qPCR est très sensible et spécifique et peut être utilisée pour détecter et quantifier de petites quantités d’ADN.
LAMP est une méthode qui amplifie l’ADN à l’aide d’une amplification isotherme (aucun cycle de température n’est requis) et repose sur la liaison spécifique d’amorces à l’ADN cible. La réaction LAMP est suivie par détection visuelle de la turbidité ou de la fluorescence des produits amplifiés. LAMP est également une méthode hautement spécifique et peut être utilisée pour détecter de petites quantités d’ADN, mais elle est moins sensible que la qPCR et peut ne pas être en mesure de détecter des niveaux aussi faibles d’ADN cible.
En bref, la qPCR est une méthode quantitative qui utilise des colorants fluorescents pour détecter et quantifier l’ADN amplifié, tandis que LAMP est une méthode qualitative qui utilise la détection visuelle de l’ADN amplifié. Les deux sont utiles pour détecter et identifier des séquences d’ADN spécifiques.
La qPCR (polymérase en chaîne en temps réel) a plusieurs avantages par rapport à la LAMP (amplification isotherme en boucle):
Sensibilité: La qPCR est généralement plus sensible que la LAMP, ce qui signifie qu’elle peut détecter des niveaux plus faibles d’ADN cible.
Quantification: La qPCR permet de quantifier la quantité d’ADN amplifié grâce à l’utilisation de sondes fluorescentes. La LAMP est généralement utilisée pour la détection qualitative.
Précision: La qPCR est généralement plus précise que la LAMP dans la mesure de la quantité d’ADN cible.
Fiabilité: La qPCR est plus fiable car elle utilise un système de rétroaction en temps réel pour suivre l’amplification de l’ADN cible, ce qui permet d’éviter les faux positifs.
Temps d’analyse: La qPCR est généralement plus rapide que la LAMP, car elle nécessite moins de temps pour amplifier l’ADN cible.
Flexibilité: La qPCR peut être utilisée pour détecter des cibles multiples simultanément, tandis que la LAMP est généralement utilisée pour détecter une seule cible à la fois.
Il est important de noter que les avantages et les limites de la qPCR et de la LAMP dépendent des applications spécifiques et des besoins en matière de détection.
